中德经济合作面临着不少挑战。从政治层面看，国际关系复杂多变，一些西方国家的地缘政治博弈会给中德合作添堵。比如美国为维护自身霸权，不断给德国施压，试图干扰中德正常的经济往来。
经济结构上，德国制造业发达，在高端制造领域优势明显，而中国制造业也在快速崛起，双方在部分产业上存在竞争。像汽车产业，中国新能源汽车发展迅猛，与德国传统汽车强国地位形成一定竞争。
另外，文化差异也不能忽视。中德文化不同，在商业合作中的决策方式、沟通模式等方面存在差异，可能导致合作效率降低。不过，挑战虽在，但中德经济互补性强，共同克服困难，合作前景依旧广阔。